皆さんは日々増加するRNA-seqデータの解析に、どのようなツールを使っていますか？ 従来のツールでは複数サンプルを同時に分析する際に精度や効率の問題を抱えていませんか？ 本記事では、機械学習を活用した次世代RNA-seqアセンブラー「Aletsch（アレッチ ...

理化学研究所（理研）生命医科学研究センタートランスクリプトーム研究チームのアレッサンドロ・ボネッティ客員研究員、ピエロ・カルニンチチームリーダーらの研究チームは、細胞核内のRNAとゲノムDNA（クロマチン[1] ）の相互作用をゲノム全体で調べる ...

次世代シーケンサーの普及により、RNA-seq（RNA sequencing）は生命科学研究において必須のツールとなりました。 この技術は、ある条件下での細胞や組織の転写活性の全体像を捉えることができ、新しい転写産物の発見や選択的スプライシングの検出、遺伝子 ...

生命科学の研究方法として、「シングルセル（単一細胞）解析」が大きな注目を浴びている。臓器に含まれる細胞を個別に解析していく研究方法であり、細胞集団を解析して平均値を捉えるこれまでの手法では見逃されてきた新しい細胞種、また、これまで ...